Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB6O95452 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB6O95452 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB6O95452 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB6O95452 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB6O95452 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB6O95452 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB6O95452 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB6O95452 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB6O95452 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB6O95452 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB6O95452 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB6O95452 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB6O95452 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB6O95452 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB6O95452 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB6O95452 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB6O95452 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB6O95452 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB6O95452 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB6O95452 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB6O95452 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB6O95452 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB6O95452 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB6O95452 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB6O95452 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB6O95452 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB6O95452 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB6O95452 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB6O95452 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB6O95452 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB6O95452 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB6O95452 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB6O95452 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB6O95452 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB6O95452 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB6O95452 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB6O95452 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB6O95452 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB6O95452 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB6O95452 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB6O95452 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB6O95452 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB6O95452 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB6O95452 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB6O95452 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB6O95452 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB6O95452 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB6O95452 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB6O95452 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB6O95452 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB6O95452 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB6O95452 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB6O95452 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB6O95452 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB6O95452 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB6O95452 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB6O95452 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB6O95452 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB6O95452 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB6O95452 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB6O95452 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB6O95452 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB6O95452 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJB6O95452 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB6O95452 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB6O95452 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJB6O95452 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB6O95452 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB6O95452 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB6O95452 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB6O95452 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJB6O95452 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB6O95452 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB6O95452 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB6O95452 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB6O95452 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB6O95452 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB6O95452 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJB6O95452 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB6O95452 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB6O95452 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJB6O95452 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB6O95452 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB6O95452 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB6O95452 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJB6O95452 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJB6O95452 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJB6O95452 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GJB6O95452 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJB6O95452 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms