Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC6AO75865 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6AO75865 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6AO75865 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms