Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB3O75712 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB3O75712 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB3O75712 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB3O75712 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB3O75712 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB3O75712 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB3O75712 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB3O75712 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB3O75712 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB3O75712 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB3O75712 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB3O75712 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB3O75712 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB3O75712 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB3O75712 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB3O75712 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB3O75712 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB3O75712 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB3O75712 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB3O75712 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB3O75712 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB3O75712 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB3O75712 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB3O75712 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB3O75712 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB3O75712 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB3O75712 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB3O75712 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB3O75712 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB3O75712 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB3O75712 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB3O75712 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB3O75712 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB3O75712 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB3O75712 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB3O75712 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB3O75712 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB3O75712 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB3O75712 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB3O75712 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB3O75712 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB3O75712 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB3O75712 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB3O75712 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB3O75712 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB3O75712 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB3O75712 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB3O75712 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB3O75712 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB3O75712 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB3O75712 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB3O75712 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB3O75712 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB3O75712 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB3O75712 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB3O75712 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB3O75712 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB3O75712 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB3O75712 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB3O75712 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB3O75712 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB3O75712 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB3O75712 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB3O75712 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB3O75712 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB3O75712 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB3O75712 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB3O75712 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB3O75712 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB3O75712 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB3O75712 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB3O75712 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB3O75712 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB3O75712 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB3O75712 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB3O75712 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB3O75712 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB3O75712 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB3O75712 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB3O75712 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB3O75712 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB3O75712 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB3O75712 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB3O75712 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB3O75712 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB3O75712 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB3O75712 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB3O75712 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB3O75712 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms