Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSO75390 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSO75390 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSO75390 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSO75390 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSO75390 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSO75390 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSO75390 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSO75390 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSO75390 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSO75390 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSO75390 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSO75390 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSO75390 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSO75390 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSO75390 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSO75390 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSO75390 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSO75390 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSO75390 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSO75390 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSO75390 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSO75390 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSO75390 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSO75390 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSO75390 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSO75390 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSO75390 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSO75390 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSO75390 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSO75390 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSO75390 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSO75390 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSO75390 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSO75390 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSO75390 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSO75390 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSO75390 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSO75390 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSO75390 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSO75390 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSO75390 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSO75390 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSO75390 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSO75390 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSO75390 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSO75390 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSO75390 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSO75390 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSO75390 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSO75390 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSO75390 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSO75390 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSO75390 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSO75390 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSO75390 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSO75390 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSO75390 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSO75390 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSO75390 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSO75390 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSO75390 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSO75390 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSO75390 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSO75390 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSO75390 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSO75390 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSO75390 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSO75390 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSO75390 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSO75390 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSO75390 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSO75390 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSO75390 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSO75390 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSO75390 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSO75390 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSO75390 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CSO75390 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSO75390 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSO75390 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSO75390 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSO75390 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSO75390 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSO75390 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSO75390 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms