Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP3O75386 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP3O75386 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP3O75386 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP3O75386 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP3O75386 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP3O75386 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP3O75386 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP3O75386 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP3O75386 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP3O75386 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP3O75386 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP3O75386 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP3O75386 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP3O75386 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP3O75386 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP3O75386 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP3O75386 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP3O75386 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP3O75386 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP3O75386 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP3O75386 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP3O75386 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP3O75386 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP3O75386 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP3O75386 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP3O75386 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP3O75386 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP3O75386 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP3O75386 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP3O75386 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP3O75386 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP3O75386 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TULP3O75386 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP3O75386 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP3O75386 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP3O75386 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP3O75386 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP3O75386 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TULP3O75386 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TULP3O75386 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TULP3O75386 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP3O75386 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP3O75386 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP3O75386 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP3O75386 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP3O75386 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP3O75386 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP3O75386 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP3O75386 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP3O75386 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP3O75386 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP3O75386 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP3O75386 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP3O75386 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP3O75386 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP3O75386 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP3O75386 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP3O75386 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP3O75386 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP3O75386 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP3O75386 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP3O75386 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP3O75386 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP3O75386 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP3O75386 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP3O75386 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP3O75386 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP3O75386 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP3O75386 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP3O75386 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TULP3O75386 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TULP3O75386 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP3O75386 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP3O75386 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP3O75386 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TULP3O75386 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms