Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PPLO60437 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PPLO60437 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PPLO60437 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PPLO60437 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PPLO60437 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
PPLO60437 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPLO60437 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PPLO60437 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPLO60437 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPLO60437 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPLO60437 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPLO60437 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPLO60437 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPLO60437 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPLO60437 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPLO60437 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPLO60437 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPLO60437 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPLO60437 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPLO60437 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPLO60437 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPLO60437 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPLO60437 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPLO60437 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPLO60437 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPLO60437 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPLO60437 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPLO60437 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPLO60437 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPLO60437 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPLO60437 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPLO60437 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPLO60437 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPLO60437 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PPLO60437 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PPLO60437 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PPLO60437 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PPLO60437 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PPLO60437 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PPLO60437 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PPLO60437 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PPLO60437 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PPLO60437 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PPLO60437 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PPLO60437 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPLO60437 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PPLO60437 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PPLO60437 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPLO60437 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPLO60437 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPLO60437 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PPLO60437 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PPLO60437 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPLO60437 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PPLO60437 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPLO60437 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPLO60437 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPLO60437 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPLO60437 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PPLO60437 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPLO60437 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PPLO60437 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PPLO60437 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PPLO60437 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPLO60437 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PPLO60437 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPLO60437 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPLO60437 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPLO60437 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPLO60437 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPLO60437 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPLO60437 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPLO60437 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPLO60437 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPLO60437 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPLO60437 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PPLO60437 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPLO60437 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPLO60437 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPLO60437 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PPLO60437 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PPLO60437 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PPLO60437 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PPLO60437 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PPLO60437 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PPLO60437 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PPLO60437 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PPLO60437 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PPLO60437 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PPLO60437 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PPLO60437 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PPLO60437 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPLO60437 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPLO60437 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPLO60437 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPLO60437 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPLO60437 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPLO60437 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PPLO60437 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms