Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCMT2O60294 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCMT2O60294 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms