Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SGSM2O43147 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SGSM2O43147 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SGSM2O43147 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGSM2O43147 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SGSM2O43147 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SGSM2O43147 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SGSM2O43147 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SGSM2O43147 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SGSM2O43147 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SGSM2O43147 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms