Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6AO15550 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6AO15550 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM6AO15550 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM6AO15550 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM6AO15550 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms