Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PER1O15534 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PER1O15534 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PER1O15534 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PER1O15534 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PER1O15534 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PER1O15534 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PER1O15534 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PER1O15534 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PER1O15534 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PER1O15534 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PER1O15534 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PER1O15534 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PER1O15534 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PER1O15534 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PER1O15534 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PER1O15534 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PER1O15534 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PER1O15534 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PER1O15534 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PER1O15534 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PER1O15534 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PER1O15534 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PER1O15534 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PER1O15534 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PER1O15534 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PER1O15534 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PER1O15534 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PER1O15534 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PER1O15534 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PER1O15534 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PER1O15534 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PER1O15534 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PER1O15534 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PER1O15534 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PER1O15534 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PER1O15534 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PER1O15534 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PER1O15534 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PER1O15534 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PER1O15534 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PER1O15534 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PER1O15534 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PER1O15534 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PER1O15534 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PER1O15534 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PER1O15534 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PER1O15534 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PER1O15534 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PER1O15534 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PER1O15534 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PER1O15534 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PER1O15534 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PER1O15534 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PER1O15534 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PER1O15534 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PER1O15534 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PER1O15534 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PER1O15534 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PER1O15534 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PER1O15534 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PER1O15534 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PER1O15534 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PER1O15534 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PER1O15534 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PER1O15534 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PER1O15534 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PER1O15534 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PER1O15534 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PER1O15534 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PER1O15534 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PER1O15534 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PER1O15534 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PER1O15534 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PER1O15534 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PER1O15534 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PER1O15534 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PER1O15534 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PER1O15534 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PER1O15534 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PER1O15534 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PER1O15534 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PER1O15534 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PER1O15534 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PER1O15534 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PER1O15534 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PER1O15534 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PER1O15534 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PER1O15534 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PER1O15534 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PER1O15534 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PER1O15534 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PER1O15534 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PER1O15534 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PER1O15534 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PER1O15534 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PER1O15534 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PER1O15534 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PER1O15534 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PER1O15534 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms