Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BML4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BML4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BML4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BML4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BML4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BML4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BML4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BML4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BML4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BML4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BML4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BML4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BML4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BML4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BML4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BML4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BML4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BML4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BML4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BML4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BML4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BML4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BML4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BML4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BML4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BML4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BML4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BML4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BML4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BML4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BML4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BML4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BML4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BML4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BML4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BML4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BML4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BML4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BML4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BML4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BML4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BML4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BML4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BML4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BML4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BML4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BML4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BML4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BML4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BML4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BML4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BML4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BML4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BML4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BML4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BML4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BML4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BML4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BML4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BML4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BML4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BML4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BML4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BML4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BML4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BML4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BML4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BML4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms