Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3P2A8K0S8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3P2A8K0S8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEIS3P2A8K0S8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms