Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPE4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A096LPE4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A096LPE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A096LPE4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A096LPE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms