Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDY1Q9Y6F8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDY1Q9Y6F8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY1Q9Y6F8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDY1Q9Y6F8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDY1Q9Y6F8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDY1Q9Y6F8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDY1Q9Y6F8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms