Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHB4Q9Y5E5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB4Q9Y5E5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB4Q9Y5E5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB4Q9Y5E5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB4Q9Y5E5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB4Q9Y5E5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms