Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP3Q9Y446 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP3Q9Y446 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP3Q9Y446 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP3Q9Y446 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms