Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML1Q9UN30 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCML1Q9UN30 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML1Q9UN30 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML1Q9UN30 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms