Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDH7Q9ULB5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH7Q9ULB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH7Q9ULB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDH7Q9ULB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDH7Q9ULB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms