Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
TNIKQ9UKE5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
TNIKQ9UKE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TNIKQ9UKE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TNIKQ9UKE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
TNIKQ9UKE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms