Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXW11Q9UKB1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXW11Q9UKB1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXW11Q9UKB1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXW11Q9UKB1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms