Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPUSD1Q9UJJ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPUSD1Q9UJJ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms