Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF11Q9UIL8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF11Q9UIL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF11Q9UIL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF11Q9UIL8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF11Q9UIL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms