Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABI3Q9P2A4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABI3Q9P2A4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABI3Q9P2A4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms