Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EBF3Q9H4W6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EBF3Q9H4W6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EBF3Q9H4W6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EBF3Q9H4W6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EBF3Q9H4W6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms