Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF407Q9C0G0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF407Q9C0G0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF407Q9C0G0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF407Q9C0G0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF407Q9C0G0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF407Q9C0G0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF407Q9C0G0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF407Q9C0G0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF407Q9C0G0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF407Q9C0G0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF407Q9C0G0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms