Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLF1Q9BQI6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLF1Q9BQI6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLF1Q9BQI6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF1Q9BQI6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF1Q9BQI6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms