Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX50Q9BQ39 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX50Q9BQ39 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX50Q9BQ39 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX50Q9BQ39 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms