Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPA33Q99795 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPA33Q99795 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPA33Q99795 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPA33Q99795 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPA33Q99795 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPA33Q99795 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPA33Q99795 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPA33Q99795 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPA33Q99795 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms