Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SIN3AQ96ST3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SIN3AQ96ST3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SIN3AQ96ST3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SIN3AQ96ST3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SIN3AQ96ST3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SIN3AQ96ST3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SIN3AQ96ST3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SIN3AQ96ST3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SIN3AQ96ST3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SIN3AQ96ST3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms