Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED12Q93074 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED12Q93074 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED12Q93074 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED12Q93074 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED12Q93074 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED12Q93074 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED12Q93074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED12Q93074 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED12Q93074 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED12Q93074 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED12Q93074 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED12Q93074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MED12Q93074 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED12Q93074 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED12Q93074 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED12Q93074 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED12Q93074 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED12Q93074 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED12Q93074 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED12Q93074 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED12Q93074 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED12Q93074 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED12Q93074 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED12Q93074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED12Q93074 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED12Q93074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED12Q93074 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED12Q93074 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED12Q93074 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED12Q93074 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED12Q93074 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MED12Q93074 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MED12Q93074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED12Q93074 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED12Q93074 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED12Q93074 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED12Q93074 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED12Q93074 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MED12Q93074 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED12Q93074 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED12Q93074 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED12Q93074 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED12Q93074 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED12Q93074 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED12Q93074 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED12Q93074 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED12Q93074 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED12Q93074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED12Q93074 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED12Q93074 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED12Q93074 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED12Q93074 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED12Q93074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED12Q93074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED12Q93074 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED12Q93074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED12Q93074 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MED12Q93074 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED12Q93074 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED12Q93074 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED12Q93074 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED12Q93074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED12Q93074 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED12Q93074 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED12Q93074 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MED12Q93074 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED12Q93074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED12Q93074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED12Q93074 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED12Q93074 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED12Q93074 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED12Q93074 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED12Q93074 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED12Q93074 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED12Q93074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED12Q93074 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED12Q93074 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED12Q93074 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms