Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE6

FBXL13, F-box/LRR-repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL13Q8NEE6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXL13Q8NEE6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXL13Q8NEE6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXL13Q8NEE6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXL13Q8NEE6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXL13Q8NEE6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms