Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC54

KCT2, Keratinocyte-associated transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCT2Q8NC54 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCT2Q8NC54 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCT2Q8NC54 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCT2Q8NC54 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCT2Q8NC54 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCT2Q8NC54 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms