Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD302Q8IX05 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD302Q8IX05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CD302Q8IX05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD302Q8IX05 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD302Q8IX05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD302Q8IX05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD302Q8IX05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD302Q8IX05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD302Q8IX05 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD302Q8IX05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD302Q8IX05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms