Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM48Q8IWZ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM48Q8IWZ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM48Q8IWZ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM48Q8IWZ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms