Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALKAL1Q6UXT8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALKAL1Q6UXT8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ALKAL1Q6UXT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKAL1Q6UXT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALKAL1Q6UXT8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms