Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT39Q6A163 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT39Q6A163 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT39Q6A163 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT39Q6A163 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT39Q6A163 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT39Q6A163 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT39Q6A163 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT39Q6A163 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms