Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BROXQ5VW32 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BROXQ5VW32 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BROXQ5VW32 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BROXQ5VW32 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms