Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
C12orf60Q5U649 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C12orf60Q5U649 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
C12orf60Q5U649 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
C12orf60Q5U649 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C12orf60Q5U649 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C12orf60Q5U649 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
C12orf60Q5U649 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
C12orf60Q5U649 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
C12orf60Q5U649 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms