Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR44Q5JSH3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
WDR44Q5JSH3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR44Q5JSH3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR44Q5JSH3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms