Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIP11Q15643 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP11Q15643 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIP11Q15643 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP11Q15643 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
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