Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PTPRKQ15262 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRKQ15262 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRKQ15262 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRKQ15262 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRKQ15262 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
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