Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
UBE4AQ14139 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBE4AQ14139 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
UBE4AQ14139 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
UBE4AQ14139 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE4AQ14139 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
UBE4AQ14139 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
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