Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TCIRG1Q13488 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TCIRG1Q13488 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TCIRG1Q13488 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TCIRG1Q13488 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TCIRG1Q13488 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
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