Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFX1Q12986 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFX1Q12986 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFX1Q12986 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFX1Q12986 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFX1Q12986 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFX1Q12986 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFX1Q12986 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFX1Q12986 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFX1Q12986 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFX1Q12986 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFX1Q12986 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFX1Q12986 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFX1Q12986 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFX1Q12986 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NFX1Q12986 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFX1Q12986 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
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