Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERVK_113P62684 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERVK_113P62684 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HERVK_113P62684 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HERVK_113P62684 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HERVK_113P62684 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms