Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1CAP62136 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1CAP62136 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPP1CAP62136 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP1CAP62136 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms