Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIF1P55008 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIF1P55008 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIF1P55008 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIF1P55008 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIF1P55008 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIF1P55008 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AIF1P55008 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AIF1P55008 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AIF1P55008 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AIF1P55008 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AIF1P55008 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AIF1P55008 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AIF1P55008 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AIF1P55008 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AIF1P55008 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIF1P55008 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIF1P55008 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIF1P55008 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIF1P55008 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIF1P55008 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AIF1P55008 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AIF1P55008 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AIF1P55008 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIF1P55008 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIF1P55008 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AIF1P55008 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AIF1P55008 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIF1P55008 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIF1P55008 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIF1P55008 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIF1P55008 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIF1P55008 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIF1P55008 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIF1P55008 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIF1P55008 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIF1P55008 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIF1P55008 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIF1P55008 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIF1P55008 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AIF1P55008 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AIF1P55008 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AIF1P55008 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AIF1P55008 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AIF1P55008 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AIF1P55008 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AIF1P55008 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AIF1P55008 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AIF1P55008 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AIF1P55008 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AIF1P55008 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AIF1P55008 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AIF1P55008 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AIF1P55008 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AIF1P55008 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AIF1P55008 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AIF1P55008 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AIF1P55008 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AIF1P55008 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AIF1P55008 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AIF1P55008 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AIF1P55008 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AIF1P55008 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AIF1P55008 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AIF1P55008 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AIF1P55008 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AIF1P55008 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AIF1P55008 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AIF1P55008 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AIF1P55008 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AIF1P55008 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AIF1P55008 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AIF1P55008 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AIF1P55008 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AIF1P55008 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AIF1P55008 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AIF1P55008 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AIF1P55008 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AIF1P55008 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AIF1P55008 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AIF1P55008 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AIF1P55008 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AIF1P55008 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AIF1P55008 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AIF1P55008 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AIF1P55008 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms