Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB3P54753 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB3P54753 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB3P54753 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHB3P54753 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms