Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HCCSP53701 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCCSP53701 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCCSP53701 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCCSP53701 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCCSP53701 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCCSP53701 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCCSP53701 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCCSP53701 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCCSP53701 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCCSP53701 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HCCSP53701 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HCCSP53701 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCCSP53701 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCCSP53701 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCCSP53701 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HCCSP53701 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCCSP53701 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCCSP53701 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCCSP53701 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCCSP53701 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCCSP53701 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCCSP53701 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCCSP53701 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCCSP53701 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HCCSP53701 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCCSP53701 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCCSP53701 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCCSP53701 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCCSP53701 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCCSP53701 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCCSP53701 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCCSP53701 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCCSP53701 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCCSP53701 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCCSP53701 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCCSP53701 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCCSP53701 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCCSP53701 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCCSP53701 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCCSP53701 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCCSP53701 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCCSP53701 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCCSP53701 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCCSP53701 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCCSP53701 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCCSP53701 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCCSP53701 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCCSP53701 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCCSP53701 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCCSP53701 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HCCSP53701 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCCSP53701 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HCCSP53701 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCCSP53701 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCCSP53701 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCCSP53701 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCCSP53701 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCCSP53701 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCCSP53701 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCCSP53701 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCCSP53701 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCCSP53701 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCCSP53701 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCCSP53701 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCCSP53701 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCCSP53701 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCCSP53701 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCCSP53701 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCCSP53701 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms