Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB27AP51159 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB27AP51159 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB27AP51159 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB27AP51159 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms